Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms