Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms