Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms