Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp4P59240 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms