Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P58686 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P58686 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P58686 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P58686 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P58686 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P58686 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P58686 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P58686 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P58686 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms