Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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