Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc1P34928 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms