Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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