Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms