Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P18524 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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P18524 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18524 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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P18524 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18524 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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P18524 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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P18524 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P18524 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P18524 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18524 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms