Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
PtpraP18052 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms