Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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