Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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