Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb1P09055 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb1P09055 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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