Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccl20O89093 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccl20O89093 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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