Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 CT573085.2-201ENSMUST00000226097 552 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tmem174-201ENSMUST00000050389 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm21560-201ENSMUST00000168480 2066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm16206-201ENSMUST00000132485 1966 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Dpf3-207ENSMUST00000178756 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms