Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5225J3QPL3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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