Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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