Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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