Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms