Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms