Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pot1bH7BX60 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pot1bH7BX60 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms