Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vmn1r58G3X9U3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms