Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Usp9yF8VPU6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Usp9yF8VPU6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Usp9yF8VPU6 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Usp9yF8VPU6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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