Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zfp607a-201ENSMUST00000053722 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rtp1-201ENSMUST00000038730 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dkk3-201ENSMUST00000033036 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Nrip3-202ENSMUST00000041460 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 BC030343-201ENSMUST00000199606 2439 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cd36-201ENSMUST00000082367 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Unc45b-201ENSMUST00000018989 3549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Rims1-207ENSMUST00000164877 2294 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Orai2-202ENSMUST00000196454 3990 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Gm20538F6Z9R1 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms