Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms