Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Phf11cB4XVP9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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