Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms