Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ssxb8B1AY40 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb8B1AY40 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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