Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1jA2BFR3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1jA2BFR3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms