Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Samt1A2BED8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Samt1A2BED8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms