Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Myom3A2ABU4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Myom3A2ABU4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms