Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms