Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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