Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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