Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms