Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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