Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms