Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms