Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Pgpep1Q9ESW8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms