Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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