Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ergic1Q9DC16 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms