Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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