Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg7Q9D906 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms