Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms