Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cldn23Q9D7D7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cldn23Q9D7D7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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