Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Syce1Q9D495 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Syce1Q9D495 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Syce1Q9D495 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Syce1Q9D495 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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