Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cfap53Q9D439 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cfap53Q9D439 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cfap53Q9D439 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cfap53Q9D439 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cfap53Q9D439 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cfap53Q9D439 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap53Q9D439 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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