Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed11Q9D2R4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms