Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Snapc3Q9D2C9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms